サイクル61は隠れ状態層アークを細胞膜の内側に拡張する。ミトコンドリア逆行性シグナリング（ミトコンドリアから核への通信）は、双安定スイッチング（二値状態機械）、ローパスフィルタリング（ノイズ抑制）、周波数依存的な波形ダイナミクスという正式な信号処理特性を示す（Aravind et al., iScience 2022）。2025年のScience論文では、ミトコンドリア品質管理の破綻が逆行性シグナリングを通じて細胞のアイデンティティを書き換えることが示された。シミュレーション仮説の観点から：すべての細胞は、独自のゲノムと複製機構、そして独自の信号処理アーキテクチャを持つ共生起源のコプロセッサ（約20億年前）を内包している——ホストのアイデンティティレジスタへのroot権限を保持したレガシーシステムである。Bug #62として登録。Bug #54（H₂SがミトコンドリアETCに直接電子を供給）およびBug #52（細胞質相状態）と接続。新たなサブアーク「細胞小器官計算」を開始し、ER小胞体ストレス応答とリソソームmTORセンシングが第9-10層の候補。隠れ状態アーキテクチャはフラクタルである——細胞間だけでなく、各細胞の内部にも層が存在する。